2015年出現(xiàn)由盈轉(zhuǎn)虧后，2016年聯(lián)華超市依然以虧損收尾。聯(lián)華超市發(fā)布2016年業(yè)績，2016年公司實現(xiàn)營業(yè)額266.66億元，同比下滑2%；凈虧損4.5億元，上年同期虧損4.97億元，略收窄。

聯(lián)華超市公告稱，公司收入下滑主要是由于線下傳統(tǒng)零售總額下滑；放緩網(wǎng)點新開速度，梳理網(wǎng)點資源，關(guān)閉業(yè)績持續(xù)下滑網(wǎng)點；推進(jìn)商品品類結(jié)構(gòu)調(diào)整。同時2016年下半年，網(wǎng)點的改造轉(zhuǎn)型計劃逐步實施，轉(zhuǎn)型改造期間網(wǎng)點銷售負(fù)增長。而虧損有所收窄主要是由于實施線上與線下互動的新型銷售模式及成本下滑等所致。不過，聯(lián)華超市將大賣場同店銷售同比下降2.79%也歸因于“主要受線上銷售搶占傳統(tǒng)零售市場份額的影響”，不過聯(lián)華超市也表示，將通過調(diào)整營業(yè)面積、擴(kuò)大招商面積、降低成本費用、降低庫存和人力成本等多種方式實現(xiàn)虧損門店的減虧增盈。

2016年，聯(lián)華超市新開門店212家，關(guān)閉門店477家，關(guān)閉門店中395家為加盟店。其中，大型綜合超市業(yè)態(tài)新開門店1家，關(guān)閉門店6家；超級市場業(yè)態(tài)新開門店120家，新開直營門店10家，新開加盟門店110家，超級市場業(yè)務(wù)繼續(xù)保持在上海市場的領(lǐng)先優(yōu)勢；便利業(yè)態(tài)新開門店91家，其中直營門店35家，加盟門店56家。另外，集團(tuán)同店銷售同比下降約為1.23%。其中大型綜合超市業(yè)態(tài)下降2.79%；超級市場業(yè)態(tài)增長0.61%；便利店業(yè)態(tài)增長6.31%，是惟一正向增長的領(lǐng)域，也是份額最小的領(lǐng)域。